جداسازی و تعیین مشخصات in silico راه انداز ژن کلیدی تاکسادین سینتاز مسیر تولید تاکسول در سرخدار

پایان نامه
چکیده

تاکسول یکی از موثرترین داروی های ضدسرطان در سال های اخیر می باشد که غالباً از گیاه سرخدار استخراج می شود. این ماده در حال حاضر به عنوان مهم ترین ترکیب طبیعی ضدسرطان با مکانیسمی متفاوت از سایر داروهای مشابه در این زمینه، در سراسر دنیا برای درمان انواع سرطان ها از جمله سرطان پوست، ریه، مجاری ادرار، مری، غدد لنفاوی و غیره به طور موثر مورد استفاده قرار می گیرد. تلاش های فراوانی برای سنتز کامل و سنتز نیمه مصنوعی تاکسول و همچنین استخراج آن از کشت های سلولی صورت گرفته که هر کدام از این روش ها مشکلات خاصی را به دنبال دارند. با توجه به مصرف فراوان این ماده در پزشکی و همچنین محدودیت تولید آن از منابع گیاهی لازم است تا مکانیسم بیوسنتز آن و همچنین عوامل موثر در افزایش تولید تاکسول به طور کامل مورد بررسی و مطالعه قرار گیرد. همکاری مشترک بین الیسیتورهای محیطی و عناصر تنظیمی موجود در راه اندازهای ژن های دخیل در مسیر سنتز تاکسول نقش بسزایی در میزان تولید این ماده دارند. لذا مطالعه ی حاضر، با هدف شناسایی و جداسازی راه انداز ژن کلیدی تاکسادین سینتاز در مسیر سنتز تاکسول در گیاه t. baccata و همچنین آنالیز این ناحیه به منظور شناسایی عناصر تنظیمی و عوامل رونویسی درگیر با راه انداز انجام شد. در این تحقیق از روش پیمایش dna جهت شناسایی و جداسازی راه انداز و از نرم افزارهای utrdb، plantcare و plantpan برای بررسی این ناحیه استفاده گردید که طی آن راه انداز ژن تاکسادین سینتاز به طول 1578 نوکلئوتید جداسازی و علاوه بر آن، تعدادی از عوامل رونویسی مانند erf1، tbp و myb و همچنین عناصر تنظیمی پاسخ دهنده به الیسیتورهای داخلی و خارجی شناسایی شدند. مطالعه ی راه انداز این ژن نشان می دهد که افزایش اتیلن که در شرایط تنش محیطی نظیر خشکی و شوری حاصل می گردد، موجب بیان عامل رونویسیerf1 شده و ژن تاکسادین سینتاز را فعال کرده و در نتیجه تاکسول تولید می گردد. همچنین، عامل myb نیز با دریافت پیام تنش اسمزی حاصل از افزایش آبسزیک اسید، بیان ژن های پاسخ دهنده به این هورمون را کنترل می کند. نتایج حاصل از آنالیز ناحیه ی راه انداز ژن تاکسادین سینتاز در سرخدار بر حضور چندین عنصر تنظیمی ویژه نظیر توالیmbs، جعبه ها یg و p دلالت دارد که سیگنال تنش های محیطی را دریافت و بیان این ژن را در شرایط مختلف تنظیم می نمایند. وجود موتیف های متعدد القاء شونده توسط نور بیانگر اهمیت این الیسیتور در افزایش تاکسول در سرخدار می باشد. از این رو، افزایش بیان این ژن توسط الیسیتورهای داخلی و خارجی موثر در فعال کردن عناصر تنظیمی راه انداز ژن تاکسادین سینتاز امکان پذیر است؛ که درنهایت منجر به افزایش سنتز تاکسول در گیاه می شود. این نکته حائز اهمیت است که نتایج بدست آمده در این پژوهش حاصل آنالیزهای نرم افزاری بوده و به مطالعه و کاربرد الیسیتورها در شرایط طبیعی گیاه به منظور افزایش این ماده، نیاز دارد. انتظار می رود که فراهم شدن عوامل محیطی موثر در القای ناحیه ی راه انداز ژن تاکسادین سینتاز، موجب بیان بیشتر این ژن کلیدی و در نتیجه موفقیت در تولید تجاری تاکسول گردد.

منابع مشابه

جداسازی و مطالعه بیوانفورماتیکی ژن عامل رونویسی TbJAMYC دخیل در بیوسنتز تاکسول از سرخدار گونه ایرانی

داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلی­تاکسل از متابولیت­های بیوسنتز شده در سرخدار (Taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردی­ترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبول­ها مانع از تقسیم سلولی در بافت­های سرطانی می­شود. عامل رونویسی JAMYC از خانواده MYC دارای موتیف متصل­شونده به DNA به‎نام bHLH می­باشد که در سایر گونه­های سرخدار شناسایی شده است. هدف ا...

متن کامل

جداسازی قارچ های اندوفایت تولید کننده داروی ضد سرطان تاکسول از سرخدار بومی ایران

زمینه و هدف: تاکسول یکی از مهمترین داروهای ضد سرطان و منبع اولیه تهیه آن گیاه سرخدار است و با توجه به محدود بودن تعداد این درختان جایگزینی روش های دیگر تولید به جای استخراج از پوست گیاه امری ضروری به نظر می رسد. با توجه به اینکه تاکنون تحقیقات گسترده و جامعی بر روی قارچ های تولید کننده تاکسول در داخل کشور انجام نشده، لذا این مطالعه با هدف بررسی روی فلور طبیعی ایران به منظور جداسازی قارچ های اند...

متن کامل

حضور ژن DBAT و تولید داروی ضدسرطان تاکسول در قارچ های اندوفیت جداسازی شده از گیاه سرخدار بومی ایران (Taxus baccata) در شرایط درون شیشه‌ای

سابقه و هدف: تاکسول یک داروی ضدسرطان با منشاء گیاهی است که به­طور گسترده برای درمان انواع مختلف سرطان استفاده می‌شود. روش­های استخراج سنتی تاکسول از گونه­های سرخدار بسیار سخت و هزینه­بر است. بنابراین، بررسی منابع جایگزین برای این داروی با ارزش ضروری به­نظر می­رسد. مواد و روش­ها: در این تحقیق قارچ­های اندوفیت از پوست سرخدار بومی ایران ( Taxus baccata ) جداسازی شدند. ایزوله­ها در محیط PDB ( Potat...

متن کامل

مقایسه توالی ژن DBAT، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، در گونه‮های سرخدار و قارچ های اندوفیت

هدف: هدف از این تحقیق، بررسی حضور ژن DBAT، یکی از ژن‌های کلیدی در مسیر بیوسنتزی تاکسول، در سرخدار (Taxus baccata) و قارچ اندوفیت مولد تاکسول آن و نیز بررسی میزان شباهت این توالی‌ها با توالی‌های موجود در بانک ژن بود. مواد و روش‌ها: در این تحقیق، قارچ‌های اندوفیت از پوست درخت سرخدار جداسازی و به روش نوک هیف خالص‌سازی شدند. DNA ژنومی درخت سرخدار و یکی از قارچ‌های مولد تاکسول (ای...

متن کامل

جداسازی قارچ های اندوفایت تولید کننده داروی ضد سرطان تاکسول از سرخدار بومی ایران

زمینه و هدف: تاکسول یکی از مهمترین داروهای ضد سرطان و منبع اولیه تهیه آن گیاه سرخدار است و با توجه به محدود بودن تعداد این درختان جایگزینی روش های دیگر تولید به جای استخراج از پوست گیاه امری ضروری به نظر می رسد. با توجه به اینکه تاکنون تحقیقات گسترده و جامعی بر روی قارچ های تولید کننده تاکسول در داخل کشور انجام نشده، لذا این مطالعه با هدف بررسی روی فلور طبیعی ایران به منظور جداسازی قارچ های اند...

متن کامل

تولید داروی ضد سرطان تاکسول در قارچ‎های اندوفیت جداسازی شده از فندق(corylus avellana)

زمینه و هدف: تاکسول یک ترکیب دی‎ترپنوئیدی است که اولین بار از درخت سرخدار و سپس از درختان دیگر مانند فندق جداسازی شد. تحقیقات نشان داده است که برخی قارچ‎های اندوفیت جداسازی شده از این گیاهان نیز قادر به تولید تاکسول هستند. ژن dbat یکی از ژن‎های کلیدی در مسیر بیوسنتزی تاکسول است که تشکیل باکاتین iii، یکی از پیش‎سازهای اصلی در مسیر بیوسنتزی تاکسول را کاتالیز می‎‎کند. هدف از این مطالعه بررسی تولید...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023